O curso de Medicina da Universidade Estadual do Maranhão (UEMA) foi considerado o melhor do estado no Ranking Universitário Folha (RUF) 2025. A instituição ocupa o 90º lugar nacional e é a mais bem avaliada nos quesitos avaliação de mercado, qualidade de ensino e dedicação do corpo docente. Em segundo lugar aparece a Universidade Federal do Maranhão (UFMA), seguida pelo Uniceuma, que completa o pódio entre as três mais bem colocadas.
Logo depois surgem Edufor São Luís, Centro Universitário Dom Bosco (UNDB) e UEMASUL, todas entre as 300 primeiras do país. O ranking analisa cursos de todo o Brasil e considera critérios como avaliação de mercado, infraestrutura, titulação de professores, permanência dos alunos e desempenho acadêmico.
Na parte inferior da lista maranhense aparecem as faculdades Pitágoras de Bacabal, FAMEAC de Açailândia, Pitágoras Saúde de Codó e Afya Santa Inês, todas com desempenho mais modesto nas avaliações nacionais.